1.肺芽生菌病半数以上患者吸入空气中的皮炎芽生菌孢子后可无任何临床症状，只有在波及其他脏器后的仔细检查，才会发现肺部的病灶。其余患者肺部可出现急性或慢性的感染症状。急性肺芽生菌病的临床表现有发热、畏寒、咳嗽、关节痛、肌痛、胸痛等似流感的症状。X线肺部表现为非特异性改变，包括肺节段性或肺叶实变，最常累及的部位为肺下叶。大多数患者2～21周后痊愈。

2.皮肤芽生菌病皮肤损害大部分由于血行播散所致，好发于面、颈、上肢和头皮等处，芜缘不规则隆起的无痛性溃疡或疣状损害。部分源自于皮下骨骼感染的直接蔓延。

3.骨关节芽生菌病少数播散性芽生菌病患者播散至骨而引起骨髓炎，X线检查不具特异性。好发部位为脊柱、长骨和肋骨。脊柱累及可导致椎间盘的破坏。侵袭周围软组织可形成脓肿和窦道。延及关节则出现关节炎。多由肺部感染的血行播散或感染的骨对其周围组织的直接蔓延。临床表现为受累关节肿胀、疼痛和运动受限，以肘、腕、踝等关节最常累及。

4.其他部位的芽生菌感染男性播散感染者中15%～35%累及前列腺、附睾，出现前列腺肿大、附睾炎、阴囊肿胀等。血行播散到脑出现脑膜炎、脊髓和大脑脓肿形成，易致死。其他播散部位包括肝脏、肾上腺、脾及引起眼脉络膜炎和内眼炎等。