当药物治疗无效时, 并非所有的患者适于或希望采用开颅手术方法治疗。另一种选择是损伤或破坏神经, 通常是在三叉神经节和三叉神经根部位,直接中断神经冲动的传输, 达到缓解和治愈的目的, 手术结果均会使三叉神经痛得到起码是暂时的缓解, 但神经根部的压迫或颅内肿瘤等原发病因并未解除。神经破坏性手术操作较MVD 简单, 当疼痛复发时可反复采用。这种手术最常见的并发症是面部感觉异常, 包括感觉增强和感觉丧失, 少部分病人发展成为难以忍受的永久性痛觉麻痹。另外一种少见但严重的并发症是角膜感觉异常, 导致角膜炎, 甚至失明。另外, 在治疗侧, 特别是接受气囊压迫治疗的患者, 咀嚼功能会减弱。当这种手术重复操作时, 并发症的发生率也相应增加。