子宫内膜异位症病变广泛﹑形态多样，手术不易切除干净，常有残余病灶，因此仅仅手术治疗是不够的，术后辅助药物治疗对缓解疼痛和减少复发都有好处，另外降低雌激素水平的药物对预防术后粘连也有一定的作用。

子宫内膜异位症治疗后的复发率较高，因此复发病例的治疗是临床上经常遇到的问题。同初次治疗一样，根据不同诉求，选择不同治疗办法。对于已经做过手术的患者，选择二次手术应特别慎重，要让患者充分知情再次复发的可能性极大，从而选择合适的治疗方案。