手术指征：①发病超过48小时，②精神反应差、发热、心率快，③腹胀、腹肌紧张、腹部压痛明显④回结肠型肠套叠非手术治疗无效者。⑤非手术治疗过程中出现了严重的并发症者，如肠穿孔、腹膜炎或疑有绞窄性肠坏死。⑥小肠型肠套叠以手术治疗为宜。⑦反复发作肠套叠者。

手术疗法：①需要手术的患儿，术前应做好充分准备，如补充血容量、配血、纠正水电解质紊乱等。②开腹复位注意保暖，避免肠管痉挛加重。首选手法复位：复位时从远端向近端轻柔捏挤套叠鞘部，使套入的头部后退，切忌牵拉颈部，以防拉断肠管或系膜血管。③切除吻合。

凡不能手法复位、肠管坏死，甚至肠管颜色转红，而浆膜损伤严重或肠蠕动不恢复者，均应行病变肠管部分切除术，并且应切除到肠管完全正常的部位，再行端端吻合。患儿一般情况不良或肠壁活动能力不肯定者宜暂行造瘘术。以后二期吻合。