(1)视力损害：是颅咽管瘤全切除或次全切除最主要的神经障碍。决定其能否恢复的主要因素是手术前视力损害的程度及持续时间的长短。一般手术前视力全部丧失超过1周者，即使手术未加重视路神经组织的损伤，也不易恢复。术前尚保留部分视力且为时不长者，如手术未加重，则术后视力、视野损害可逐渐恢复。
(2)尿崩症：颅咽管瘤切除手术中，垂体柄及漏斗损伤或中断的发生率较高，尿崩症的发生、治疗与替代疗法已成为术后处理的重要课题。手术后临床观察及动物实验证实，垂体柄切断后可出现3个时段：
①即刻性多尿：在手术后数分钟至数小时后出现，可持续数小时至数天，为神经垂体创伤性休克所致的抗利尿激素(ADH)释放障碍的结果。
②间歇期：术后第1～3天内尿量排出减少或正常，可能由于下丘脑‐垂体神经束坏死及退行性变，使贮存于神经组织内的ADH释放，血ADH水平重新升高所致。此期用神经垂体素进行替代治疗需减量，以免造成体内ADH水平过高，引起反弹性水中毒，出现体内水分潴留、低渗血症、稀释性低血钠，造成严重的下丘脑与额叶水肿。因此，需结合血、尿渗透压、尿比重与尿排出量，及时调节输液量与ADH的替代治疗。
③永久性尿崩症：在手术后数日出现，由神经元退行性变达到神经核，使ADH分泌减少所致。
尿崩症的治疗，主要使患者排尿量控制在每日3000ml以内。轻者可补充输液，并给予噻嗪类药物(如氢氯噻嗪等)。此药为利尿剂而治疗尿崩症，其原理尚不清楚，给药后尿量可减少一半。此外还可给予卡马西平、氯磺丙尿(是一种降血糖药，有抗利尿作用)等。如损伤较重则需给予神经垂体素(天然加压素)作为激素替代疗法，效果较为确切，同时注意水、电解质平衡，防止钠潴留，限制钠盐入量，补充钾盐。症状持续较久者，可给予长效尿崩停。近年还有给予经过改良的人工合成的加压素类似物DDAVP(desamino‐8‐D‐arginine vasopressin)，其作用较天然神经垂体素大而持久，且无血压升高等不良反应，早期可给予其静脉滴注剂，一次给药后效用持续18小时，患者清醒后改为口服或鼻腔内喷雾，其药量相当于静滴的10倍。10%～15%的患者，垂体柄切断后3年内可恢复，这可能与下丘脑视上核、室旁核内巨细胞又形成新的神经血管单位有关。
(3)垂体功能减退：严重者出现垂体功能低下危象，需根据病情，采取紧急的抢救措施。其中最主要的是肾上腺皮质功能减退，与手术密切相关。一般术前检查已有肾上腺皮质功能低下者，术前给予激素进行准备，术中给予补充。一般脑部手术后早期给予大剂量可的松作为手术应激疗法，持续3～4天，然后减至维持量且改为口服。这时给予大剂量激素，还可起到抗脑水肿的作用。一般给予地塞米松或甲泼尼龙(methylprednisolone)，后者起效更迅速，15分钟即达血浆浓度高峰，且盐皮质激素样作用弱，短期使用对下丘脑‐垂体‐肾上腺轴无影响，且较前者更适宜大剂量冲击治疗，待病情平稳后逐渐减量。在脑水肿消退后不再继续给药，但对于垂体柄损伤或切断的患者，则需持续给予适当维持量(相当每日氢化可的松10～30mg)作为替代治疗，并在某些诱因(如感染、疲乏等)侵袭时适当增加药量，以免病势加重。60%～80%垂体柄切断的患者可发生甲状腺功能低下，需用甲状腺素替代治疗。此外，年轻妇女及青春期男性还需给予促性腺激素的替代治疗，以免其FSH、LH分泌不足而产生症状(如妇女闭经、男子性功能低下等)。
(4)下丘脑损害症状：可表现多种多样，如嗜睡、热量代谢调节失常等。此外，对于经终板入路手术的患者，尤其在儿童及青年中，常于术后1～6个月出现中枢性食欲失常，表现为贪食等，可停激素及对症治疗。第三脑室内颅咽管瘤如与下丘脑壁或大脑内静脉粘连，手术时损伤该区可致昏迷、尿崩及盐耗综合征(salt‐wasting syndrome)。
对于颅咽管瘤，外科治疗仍然是其治疗的主要方法，适用于各种类型(囊性、实性和混合性)，其效果比较确切，术后病人的生存率高，复发率低，尤其是全切的患者。但外科治疗是一种有创的方法，术后常出现不同程度的并发症，尤其是对于术后复发再次手术的患者。而对于手术无法全切的残余肿瘤、复发的颅咽管瘤、不愿接受手术治疗或病情较差不适宜手术治疗的患者，立体定向放射外科不失为一种安全有效的方法。此方法对实性颅咽管瘤疗效比较确切，对有较大囊腔的颅咽管瘤可以先行囊腔穿刺抽吸囊液后再行立体定向放射外科治疗。而对于囊性颅咽管瘤，则可行立体定向囊腔内放射治疗或内化疗，但目前更倾向于内放疗。