检测自身抗体有利于类风湿关节炎(RA)与其他炎性关节炎如银屑病关节炎、反应性关节炎和退行性关节炎的鉴别。RA新的抗体不断被发现，其中有些抗体诊断的特异性较类风湿因子(RF)明显提高，且可在疾病早期出现，如抗环瓜氨酸肽(CCP)抗体，抗核周因子(APF)抗体、抗角蛋白抗体(AKA)以及抗Sa抗体等。

(1)类风湿因子(RF)：约70%的患者阳性，其滴度一般与本病的活动性和严重性呈比例。但RF并非RA的特异性抗体，甚至在5%的正常人也可以出现低滴度的RF。

(2)抗角蛋白抗体谱：包括抗核周因子(APF)抗体、抗角蛋白抗体(AKA)、抗聚角蛋白微丝蛋白抗体(AFA)和抗环瓜氨酸肽(CCP)抗体。其中环瓜氨酸肽是该靶抗原中的主要的成分，因此抗CCP对RA的诊断敏感性和特异性高，已在临床中普遍使用。这些抗体有助于RA的早期诊断，由于其表位都含有瓜氨酸，故称之为瓜氨酸相关自身免疫系统，此系统可能在RA的发病及发展中起作用。