根据发病的急缓可分为急性和慢性寄生虫病，但大多属于慢性。另外，许多寄生虫病属于动物源性疾病(人兽共患病)，即人类和脊椎动物间自然传播的疾病，由共同的病原体引起。

根据传播情况又可分为三类：①以人类间互相传播为主，也可传给其他动物，称为人源性人兽共患病。②以动物中互相传播为主，但可经常传染给人的称为兽源性人兽共患病。包括从脊椎动物直接获得感染的，通过节肢动物或软体动物中间寄主传播的如美洲锥虫病等。③以在野生动物中传播为主，偶可传染给人的称为野生动物源(或森林源)性人兽共患病，如罗得西亚等。

根据在寄主体内寄生部位的不同，又可分为：①腔道寄生虫病。②组织内寄生虫病，如旋毛虫病等。③血液及淋巴系统内寄生虫病。④皮肤寄生虫病。