三元医学理论较之以前的医学理论，主要有以下进步：

1 它第一次把中医理论描述的明白。中医理论象一棵树，上面三个分枝，分别是毒、郁、虚。毒又若干枝，叫(风毒、火毒、热毒、疮毒、血毒、湿毒、瘟毒，淋毒、癣毒等，结合病变部位的毒)，郁分气血痰湿食水脂的不通畅不流行，虚分气血阴阳的不足。至此，中医的病因病机辩证分型清晰透明，外行能听明白，实现了中医理论的现代化。三元医学理论不再使学医成为畏途，简单明了，甚至是一看就会。

2 三元医学理论成为大道归一，上善若水的医学完美理论。因为三元毒郁虚结合病人综合考虑，就做到了三元归一了。这个上善的理论，使用者溶于心中，象水溶于万物一样，“以无法为有法，以无限为有限”，医学水平就达到炉火纯青的地步。因为一是至高之数，三元合一，化大道于无形。

3 这个理论使学中医方便了，听者也明白了。不再受中医辩证难、用药难的困惑了，因为把中医理论彻底的厘清了。

4 三元医学理论使医学理论反璞归真，大道归宗。这个理论也非常符合道家的"大道若无"的概念，也符合道家"无"的要求，尽量使理论简明扼要。这个理论也符合李小龙截拳道的“无”的理念。李小龙曾经认为，“最简单最直接的打击方法，才是最实用最有效的打击方法”。

5 武学文的三元医学理论，要求把医学教科书重新编写，强调编写以三元理论的毒郁虚为脉络。武学文当前曾经把《药物学》、《方剂学》，按三元分类。

6 武学文发展了毒的理论，分清了一些以前似是而非、容易混淆的概念。如风毒，指以感冒为主的毒，火毒是头面口舌为主要症状表现的毒，如口舌生疮，眼目红赤，头昏无力。热毒指发热，血毒是火热出血，或肌肤红斑、锦纹。湿毒指肠胃病，肝病的毒。武学文并提出了淋毒的概念，淋毒指肾、膀胱、前列腺病的毒。并有癣毒等概念。武学文强调分毒的性质和毒的病位，弄清两者就知道如何治疗疾病了。武学文强调温热性质的解毒药和芳香性质的解毒药的应用。武学文第一次提出肠胃炎属于湿毒，使人们有了芳香化湿就是解毒的概念。阳气虚易出现寒毒，有不少散寒温阳药有解毒作用，如丁香肉桂白芷的解毒作用。

7 武学文发展了郁的概述，郁指气血痰湿食水脂在体内的不畅不行不通郁滞的状态。它第一次区别于气郁的郁，在理论上是一个突破。

8 武学文强调补虚药中，温阳散寒药应归于补阳药的范畴。温阳散寒止痛，武学文认为，本质是治阳气虚的方法。

9 武学文强调辩证时，不再以阴阳为辩证的总纲，而是以三元医学理论为总纲。因为这个三元医学理论无所不包，甚至把阴阳辩证也包含了进来。第一次使医学理论可以超越并走出阴阳的樊篱，不受阴阳的约束。如阴毒可说成是寒毒，阳毒定为热毒，还有更多，并没有不可脱离阴阳之事。

10 三元医学理论在辩证上，没有任何病不可辩，消除了以前那些诊断不清，辩证不明，或无证可辩的状态。也消除了以前辩证中每个门派得出不同结论的状态。学三元理论的医师，辩证结论总是出奇的一致，治疗方案更加统一，用药也就达到了一致性。这样最明显提高了治病的效果。

三元医学理论使中医学从阴阳中走出来，进入三元医学时代。非此即彼、非上即下的二元论，终将被强调左中右、上中下的三点论所取代，知道还有“中”这个大概念，因此分析问题不再有偏颇，它的正确性、合理性是不用置疑的。《易经》说“道生一，一生二，二生三，三生万物”，否认了“阴阳生万物”这一说法，三元医学理论符合易家精神。

三元医学理论的进步，归根结底是学习中医的容易，看病时不再一个大夫看完下一个诊断，辩证结果的统一，表明辩证的精准，治病效果大大提高。