慢性乙型肝炎的病人用药不宜过多过杂，药物基本都是经过肝脏「解毒」代谢，用药过多过杂会增加肝脏负担，会加重已经存在的慢性乙型肝炎病情。目前主流的抗乙肝病毒药物分为口服抗病毒药物和注射的药物。
口服抗病毒的药物使用上方便，疗程长，不可轻易停药。基于服用的方便性和疗效的可靠性，大多数人使用口服抗病毒药物。慢性乙肝的抗病毒药物以核苷酸类似物为主。如富马酸丙酚替诺福韦片（科菲克）可以强效持续抑制乙肝病毒DNA的复制，延缓病毒对肝脏的损害和疾病的进展，耐药性较低，对骨骼及肾脏的安全性较高。
干扰素治疗副作用相对来说大一些，比如发热，乏力，脱发，但是疗程相对短，停药副作用可消失。可以随时停药。对于少数优势人群，比如病毒量不高，表面抗原不高，选择干扰素治疗，部分人可以达到临床治愈。 具体选用哪一种药物，医生经过评估以后，结合病人意愿，可以选择不同的治疗方案。
乙肝治疗最需要注意的就是和医生密切配合，积极沟通，使得慢乙肝这个慢性病的治疗取得一个理想的效果。控制病情发展，提高生活质量。