扁桃体位于消化道和呼吸道的交会处，按其位置分别称为腭扁桃体、咽扁桃体和舌扁桃体。以腭扁桃体最大，通常我们所说的扁桃体即指腭扁桃体。腭扁桃体有一对，呈扁卵圆形，位于腭舌弓与腭咽弓间的扁桃体窝内，是淋巴组织与上皮紧密联结构成的淋巴上皮器官，如下图所示。

       咽部是饮食和呼吸气的必经之路，经常接触较易隐藏的病菌和异物，咽部丰富的淋巴组织和扁桃体执行着机体这一特殊区域的防御保护任务。

       扁桃体是口咽部上皮下的淋巴组织团块，可产生淋巴细胞和抗体，起着过滤口腔内细菌的作用。若没有扁桃体，呼吸的时候就会把细菌直接吸到上呼吸道里面，容易引起感冒发烧，故具有抗细菌抗病毒的防御功能。

        特别是在12岁以前，扁桃体的免疫功能可以补足人体免疫系统的不足，表现为代偿性肥大，成为人体抵御疾病的重要防线。