蒙医科成立于1984年，是兴安盟地区重点学科，其内设肝病、风湿免疫、传统疗术等专业，形成了集门诊、病房、医疗护理为一体的综合性传统医学科室。其中五疗室具备各种蒙医疗术使用的设备外，还配备康复理疗及功能锻炼的设施。科室现有床位30张，人员16名，其中主任医师3名，副主任医师2名、主治医师2名、住院医师1名，副主任护师1名。科室业务骨干曾在北京友谊医院、北京中医药大学附属东直门医院、中日友好医院、内蒙古医学院第一附属医院进修学习。蒙医科在20多年的临床工作中，注重传统医学与现代医学的结合，运用传统诊断和先进诊断手段相结合，充分发挥蒙医药特色，在开展蒙医内科常见病、多发病的诊治基础上，蒙医开展对肝硬化、萨病、小儿癫痫、顽固性呃逆及荨麻疹等疑难杂症、高血压、冠心病、风心病、心肌病、脑血管疾病（脑出血、脑血栓、格林巴利综合征、脑炎等）、血管神经性头痛、肺气肿、肺心病、急慢性心功能不全、急慢性肝胆疾病、慢性胃炎、结肠炎、糖尿病等疾病的诊治。风湿免疫方面：系统性红斑狼疮、皮肌炎、系统性血管炎、各种关节炎（包括类风湿性关节炎、强直性脊柱炎、牛皮癣性关节炎、反应性关节炎、骨性关节炎等）、成人斯蒂尔病, 痛风，结节性红斑、硬皮病、白塞病、过敏性紫癜等。蒙医传统放血和灸疗治疗颈椎病、腰椎病、骨关节病、面神经麻痹、偏头痛、中风偏瘫、高血压病、萨病、肺心病等疾病，取得较好的临床疗效。

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