南京市妇幼保健院妇女保健科即南京市妇女保健所，创建于1986年。目前承担着全市妇女保健工作的业务指导和技术监督工作，开展了妇女病防治、妇女健康体检、青春期保健、孕前保健、围产期保健、更年期保健、妇女心理保健、妇女营养保健、乳腺保健等围绕女性整个生命周期的各项保健服务，目前科内有正主任医师3人，副主任医师7人，主治医师5人，住院医师5人。
　　南京市妇幼保健院妇女保健科每年服务对象达数十万人次，每月两次免费的《健康教育大课堂》讲座能充分发挥健康教育的优势，每年数次不定期深入机关、厂矿、企事业单位、大中专院校等进行系列健康讲座，普及妇女保健相关知识，调查掌握妇女健康状况，主动采取促进妇女健康的措施，为提高全市妇女健康水平积极贡献，先后获得“江苏省巾帼示范岗”、“妇幼保健先进集体”、“文明妇幼保健所”等光荣称号。近年来，通过加强科室内涵建设，培养人才梯队，学科综合实力和专业指导地位大大提高。每年主持国家级、省级继续教育项目数项，承担中华医学会教育分会、市卫生局、南京医科大学多项科研项目。在妇女保健领域居省内领先水平，近年来获得省厅新技术引进奖二等奖2项，市科技进步二等奖1项、三等奖2项；2012江苏省妇幼保健新技术引进一等奖二等奖各1项，江苏省卫生厅医学新技术引进一等奖1项，多次获医院“四新成果奖”和管理创新奖。2012年成为南京市医学重点专科及江苏省妇幼保健重点学科。

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