南方医科大学中西医结合医院内镜中心位于门诊5楼，共有4间独立的内镜诊疗室，附设内镜洗消间、储镜间、复苏室。中心拥有先进的日本FUJINON和OLYMPUS内镜主机及相配套的电子胃镜、结肠镜、支气管镜和鼻咽喉镜。中心全区域均安装了空气净化器，并拥有与诊疗不同部位的内镜相配套的内镜清洗工作站和全自动内镜洗消机、超声清洗机、专用内镜储存柜，能保证按国家标准对内镜及附件进行高水平的清洗消毒，杜绝院内感染。中心还拥有德国ERBE高频电刀和内镜电外科工作站、众多内镜诊疗配件，以及13C红外光谱仪。

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