腹部外科是在原赣州市三六二医院外科、肛肠科的基础上成立的，2004年被市卫生局授予赣州市市直医学重点学科，现主要进行肝胆肿瘤、胃肠肿瘤、腹部泌尿肿瘤、肛肠疾病和普外及泌尿疾病的诊断和外科治疗及肿瘤的介入治疗等综合治疗。全科现有医生6人，其中高级职称3人，中级职称1人。中级职称以上人员均在北京、上海、广州等地经过多次进修学习。科室开展床位45张。
　　腹部外科现能常规开展的较高水平技术项目有：肝癌的手术切除及介入治疗、肝癌的消融治疗、巨大肝癌缩小后再手术、胃癌及结直肠癌根治性手术、腹膜后肿瘤切除术、胰头十二指肠切除术、肝门部胆管癌根治术、肾癌及膀胱癌根治性手术，肿瘤病人的营养支持治疗等。均在本地区处于领先的水平。在肝癌的治疗方面，已完成3000余例病例，存活十年以上的有十余人，另外肛肠疾病的治疗也是我们一大特色。
　　腹部外科还承担了赣南医学院、赣州卫生学校等省内多所医学院校的教学任务，并接受来自于基层的进修医生。近年来全科承担了市卫生局计划课题和科技局鉴定课题近十项。在省级以上期刊上发表论文10余篇，科室多人在省市级各种学术团体中担任相关职务。曾被授予市“创新文明示范岗”，多次被医院评为“先进科室”，2008年我科荣获“江西省医德医风示范科室”荣誉称号。

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