肛肠科成立于1960年，目前开放床位45张。经过多年的发展已成为集医疗、科研和教学三位一体的具有省内领先水平的专业化科室。目前科室为安徽省中医药学会肛肠专业委员会挂牌单位、省级重点中医专科标准的科室，并且是安徽省技术力量最强大的肛肠外科。科室拥有专业人才梯队：主任医师2人，副主任医师1人，主治医师4人，医学硕士4人。
　　肛肠科检查治疗设备先进，配备齐全，现有大力神全电脑肛肠手术综合治疗仪、坐浴熏洗仪、肛肠测压仪、微波痔疮治疗仪、双孔冷光源检查仪、二氧化碳激光治疗仪、电子直肠乙状结肠镜、直肠腔内B超、红光理疗仪、磁热腔内理疗仪、腹腔镜等先进设备，医院还配有64排螺旋CT、磁共振(MRI)、电子结肠镜、X光机(CR、DR)、肛肠盆底肌电图等大型设备。
　　肛肠科在肛门大肠疾病治疗方面经过多年发展已经达到国内先进、省内领先水平。目前对环状混合痔、高位复杂性肛瘘、各种便秘、慢性非特异性溃疡性结肠炎、结直肠肿瘤等疑难病的治疗有新的突破，其中混合痔吻合器环切术(PPH)及 痔上黏膜套扎术(RPH)等先进治疗方法系我省最早开展并最先进行推广，在全省同行业内竖立了标杆地位，对于内痔、外痔、混合痔、肛裂、肛周脓肿等临床常见病多发病方面更是积累了丰富的经验。

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