脑病科分为脑病一科和脑病二科，脑病一科驻马店市中医院脑病一区是国家中医药管理局“十一五”重点专科建设单位，是全国帕金森病协作单位。本专科成立于1986年，始终以“突出中医特色，走中西医结合之路”为指导思想，以降低脑血管病致残率、减少复发率、提高临床治愈率、不断提高脑血管病诊疗水平为目的,以“中风(脑梗塞、脑出血)、眩晕、头痛、帕金森氏病、痴呆”为研究重点。在中医的“整体观念，辨证施治”理论指导下，创立了针对脑血管病不同时期，采用中药、西药、针灸、按摩、理疗、现代康复等中西医综合治疗的系列方法体系，形成了既重视药物治疗，又强调针灸康复配合；既重视规范化，又强调个体化；在中风病的治疗上重视活血通络作用，重用虫类药物，在眩晕治疗上重视化痰祛风等学术思想，从而极大提高了中风病(脑梗塞，脑出血)的治愈率，降低了致残率。脑梗塞急性期开展有超早期溶栓治疗；大面积脑出血病人开展有微创钻颅碎吸疗法；中风(脑梗塞，脑出血)恢复期，开展有现代康复治疗及针灸、按摩、中药熏蒸、穴位封闭等中医特色治疗。
　　脑病一科开展有脑血管造影及脑血管支架植入术等检查治疗方法。研制有治疗中风病的系列院内制剂：康复胶囊，归芪通脉丸，滋肾通脉丸，平肝通脉丸，天麻饮，头痛一号等，针对病人的不同病情及分期，辨证给药，疗效显著。
　　脑病二科是医院建设以来成立最早的综合性内科，是市重点专科。全科医护人员坚持以病人为中心，为广大患者提供优质高效的服务。坚持以中医治病为主、突出中医特色，中西医结合，在治疗老年病以及各种内科疑难杂症方面具有独到之处，尤其在治疗抑郁、焦虑、睡眠障碍等疾病形成了一整套、完整的治疗方案，研制的纯中药制剂“抗抑郁丸”、“睡眠一号”等系列中成药深受广大患者的青睐。积极开展技术攻关和临床研究，率先开展脑血管疾病的介入治疗，如脑血管造影、颅内动脉瘤的栓塞治疗等，采用钻颅碎吸等微创技术治疗脑出血等。在脑血管疾病的康复治疗方面应用中医中药、针灸、推拿按摩、心理疗法等，具有疗效高、费用低、致残率低、复发率低等优势。

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