儿科是申报湛江市十二.五中医重点建设专科，该科是广州中医药大学附属医院和湛江中医学校附属医院教学基地。该科是以中医为主，中西医结合治疗小儿多发常见疾病，集医疗、教学、科研为一体的临床学科。
　　儿科现拥有湛江市名中医1人，主任医师、教授1人，高年资主治医师、讲师2人，硕士研究生1人。
　　儿科传统中医特色鲜明，充分发挥中医药简、便、验、廉的特色优势，积极开展中医药制剂改革，运用现代先进技术研发的中药颗粒等剂型的“内服与外治”相结合治疗小儿咳嗽（支气管炎）、小儿哮喘等取得好疗效。该科新建儿科外治室，开展小儿推拿、捏脊、针灸、贴敷学术传承，技术创新，指导硕士研究生开展多项市级科研课题，如中药结合捏脊穴位贴治法治疗小儿哮喘症临床研究等取得可喜成果。湛江市第二中医医院儿科在本地区群众中享有较高的品牌口碑。

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