儿童牙科，是福建省成立最早最大的口腔专业科室。现有医生6名，其中高级职称2人、中级职称2人、初级职称2人，有7台进口牙科综合治疗机。在治疗中，严格保证“1人1牙科钻头制”，把交叉感染的危险性降到了最低水平。
　　厦门口腔医院儿童牙科无论是在医护人员素质方面，还是在硬件设备上都是全省一流的，这就为良好的治疗水平提供了保证。科室工作重点是治疗各种儿童口腔疾病，如：龋病(蛀牙)、牙髓病、根尖周病、儿童牙外伤、儿童牙周病、粘膜病、唇舌系带过短、上前牙间隙过宽、牙列不齐、多生牙等。还负责各种口腔疾病的预防工作，如：龋病的预防(窝沟封闭、氟保护漆、氟离子透入、预防性充填等)，牙周病的预防(洗牙)，口腔健康教育，口腔卫生指导等工作。

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