胆道外科主要从事于胆道相关系统疾病以及腹膜后肿瘤的诊断和治疗，包括胆囊结石、胆囊息肉的腹腔镜手术（包括保胆手术）；复杂的胆道疾病（包括肝内外胆管结石、胆囊癌、胆管癌、胆道狭窄、胆道损伤、胆管囊肿等）手术治疗；梗阻性黄疸、胰腺肿瘤以及急慢性胰腺炎的诊断和治疗；腹膜后肿瘤以及其他普通外科疾病的手术治疗。尤其在腹部复杂手术联合血管重建和腹膜后巨大肿瘤诊治方面，胆道外科拥有雄厚的技术力量和丰富的临床经验。
　　胆道外科梯队建设：胆道外科是一支老中青结合、团结协作、德才兼备、蓬勃发展的团队；是一支具有丰富临床经验和较高学术水平的专业队伍。实际开放床位30张，其中主任医师3人，副主任医师1人，博士生导师1人，硕士生导师两人。
　　胆道外科学术水平：胆道外科团队紧跟专业国内国际发展前沿，在胆道疾病基础和临床研究方面处于福建省领先水平，目前承担着国家自然科学基金一项，福建省自然科学基金2项，中国博士后基金1项，已结题或在研课题共十一项，科研经费约200万。承担的科研课题《肝移植胆道并发症及围手术期处理的基础与临床研究》荣获教育部高等学校科学技术进步一等奖；《肝门部胆管周围血管丛形态学改变对肝门部胆管及肝脏影响实验研究》荣获厦门市科技进步一等奖，是厦门市卫生系统十余年来零的突破；《门静脉动脉化用于肝脏和肝门部战外伤及肝门部胆管癌的系列研究》荣获中国人民解放军科技进步二等奖。在国内外杂志发表论著百余篇，SCI收录12篇。目前正在筹建实验室和研究所，这将为今后的研究工作提供更加广阔的平台。
　　胆道外科教学工作：胆道外科有博士生导师一名，硕士研究生导师两名，每年招收和培养硕士研究生2-4名，目前博士后工作站入站一人，计划年招收博士后科研人员1名。每年接受来自福建医科大学、福建中医学院及厦门大学医学院等的见习、实习生。

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