中山大学孙逸仙纪念医院小儿外科是一个专门为患有先天性疾病和肿瘤等疾病的婴幼儿和儿童实施手术治疗的专科,主要从事小儿普外、小儿泌尿、小儿肿瘤外科等方面的临床和科研工作。现由知名的小儿外科专家、华南地区小儿外科学界首位国家自然科学基金获得者邓小耿副教授主持工作。在小儿消化系和泌尿系先天性畸形及各种良、恶性肿瘤等疾病的治疗中积累了丰富的经验,主攻肛肠、胆道和泌尿系畸形以及神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、畸胎瘤等恶性实体肿瘤的诊治，对小儿血管瘤、隐匿型阴茎、尿道下裂、先天性肾积水等治疗具有丰富的经验。率先开展了小儿腹腔镜技术，尤擅长腹腔镜巨脾切除术、胆总管囊肿切除术、巨结肠根治术、睾丸下降固定术和疝囊高位结扎术等微创手术并取得良好疗效。在国内外权威学术期刊发表论文数十篇。承担了“胚胎干细胞中肝干细胞的筛选及在治疗性肝再生中的应用”、“miR-122调控ESC向肝细胞分化的分子机制”、“NGF导向性N-myc shRNA蔓病毒载体的构建及诱导NB分化的分子机制”等多项国家级、省部级科研攻关项目。
　　邓小耿任小儿外科主任。

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