泌尿外科是市级重点学科。现有主任医师2名，副主任医师2名，住院医师3名，设有床位40张。省硕士学位3名。泌尿外科创建于80年代，壮大于90年代，常规开展从肾上腺、肾脏到前列腺、尿道的所有泌尿外科手术，如:肾上腺肿瘤切除、肾实质切开取石、肾癌根治、肾部分切除、尿道下裂I期成形术等。近年还开展了前列腺癌根治术、膀胱全切回肠原位膀胱等高难度手术。1990年开始开展肾移植，1993年《异体肾移植和自体肾移植手术的临床应用》获衢州市科技进步三等奖。近十年主要致力于开展腔内微创泌尿外科手术，先后引进了Storz汽化电切镜、腹腔镜、输尿管镜、气压弹道碎石机和全自动尿动学检查仪等设备。目前，经尿道前列腺汽化电切、膀胱肿瘤电切、尿道狭窄冷刀切开、输尿管镜下气压弹道碎石取石已经是常规手术。2003年开始开展腹腔镜手术后，肾盂输尿管切开取石、肾囊肿去顶、肾上腺肿瘤切除已经常规开展，还开展了肾盂成形、腔静脉后输尿管成形、输尿管膀胱再植、肾部分切除等复杂腹腔镜手术。男性科配备精液分析仪，开展男性不孕症，男性功能障碍的诊断和综合治疗。在隐匿性阴茎整形方面有独到的经验。

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