福建医科大学附属泉州一院儿科始建于1953年，历经几代人的努力，儿科在泉州、乃至福建省儿科界享有较高的声誉，在闽南地区有较强的综合实力。是福建医科大学非行政隶属附属医院及其他医学院校重要临床教学基地，有强有力的师资队伍，每年培养福建医科大学本科生50-60名，是我市儿科医疗教学中心。儿科学教研室被评为教学工作先进部门。目前已发展成为泉州市儿科的医疗、教学、科研中心。儿科曾为我市儿童医院的建设起重要的作用，为其输送大量的医疗护理骨干，亦为我市儿科医疗技术力量培养了大量的人才。2010年儿科通过福建省住院医师规范化培训基地评估。
　　东街院区目前儿科病区分为儿内科及新生儿科。儿内科分为儿科重症、血液、肾病、呼吸、消化、专业组。新生儿监护病房占地200多平方米，设置床位20张，拥有多台美、德等国生产的高级呼吸机、CPAP简易呼吸机、新生儿暖箱、新生儿辐射保暖台、蓝光治疗仪、多功能监护仪、微量输液泵、微量血气分析仪、C反应蛋白检测仪、微量血电解质检测仪、听力筛查仪、经皮胆红素测定仪、头颅B超等多种先进设备，同时配备中央监控设备。门诊开展有血液、哮喘、癫痫、肾病、心血管、儿童保健、新生儿随访专科。城东院区门诊、急诊已投入使用，儿科病房将有四各病区，拟分为新生儿监护病区、儿科重症及呼吸病区、血液肾病及内分泌病区、神经消化及心血管病区。2011年3月上旬城东新院区儿科病房已开始收住病人。

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