肾脏病学科于1978年由黎磊石院士领导成立，是创建中华肾脏病学会的发起单位之一。1985年开始招收硕士研究生，1986年核准为全军第一个肾脏病医学专科中心，发起组建了解放军肾脏病专业委员会并担任主任委员。1992年被批准为全军肾脏病研究所。1997年被批准为全军肾脏病重点实验室。1992年经国家教委批准为南京大学医学院临床学院，并于1995年开始在南京大学招收博士研究生。2000年被列为全军“重中之重”学科。2001年被确立为江苏省医学重点学科和重点实验室。2003年国务院学位委员会批准为博士点。2011年成立了全国首个“肾脏病转化医学研究中心”。2011年3月公布的《中国医院最佳专科排行榜》，南京军区南京总医院全军肾脏病研究所位居榜首。
　　肾脏病学科的宗旨是“一切为了病人，不断为病人提供更好的服务”，为了践行上述承诺，研究所在不断追求优质医疗中，一次又一次地挑战现有医疗格局和传统医疗模式，形成了反映现代临床肾脏病学特色的学科布局。在国内同领域中，没有一个单位具有研究所目前所拥有的医疗项目和技术水平。今天的肾脏病研究所拥有专病化的专科门诊、临床治疗中心、肾活检诊断中心、血液净化中心、腹膜透析中心、肾移植中心、肾脏病重症监护病房(RICU)、干细胞移植病房及肾脏病重点实验室。是目前全球为数不多集上述功能为一体的临床专科。肾脏病研究所每年接纳26万来自全国各地的门诊病人。临床治疗中心拥有210张床位，年收住病人8000人次，年肾活检5000余人次。血液净化中心年常规透析近40000人次。每年完成连续性血液净化的病例数达483例，腹膜透析患者年增长140例。肾移植中心年肾移植量近100例。这种学科布局不仅适应肾脏病一体化的诊疗需求，而且也为学科全面发展奠定了坚实的基础。

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