南京军区南京总医院康复医学科始建于1930年，当时为中央医院电疗科。历经抗日战争，至1946年为物理治疗科。1954年11月医院根据形势需要成立理疗科。1986年医院整编，理疗科更名为康复医学科。更名后的康复医学科陆续购置了全套康复设备，专业从事康复医疗。康复医学科现有康复医师3名，其中高、中、初级各一名，康复治疗师6名。目前科室配备业内高端进口理疗康复器械如：超短波、微波、超声波、热磁振、中频治疗仪、冷疗仪、颈椎牵引器、腰椎牵引床、功率自行车、关节牵引椅、股四头肌训练椅、平行杆、智能肢体康复训练系统等等。
　　康复医学科以“全心全意为军内外病员康复治疗”为宗旨，以“团结协作的康复医疗团队”为基础，按照国外现代康复治疗的理念，充分发挥临床医疗和康复医疗一体化的优势，康复与临床紧密结合，为患者提供科学、系统、规范的康复治疗。临床医疗工作包括：门诊康复治疗和住院床边康复治疗。康复治疗的方式、方法和环境注重人性化，并从心理上给予病人亲切感。逐步建立并规范了神经康复(如脑出血、脑梗塞、脑外伤、脑手术后、脊髓损伤、周围神经损伤等)和骨科围手术期康复(如四肢骨折、人工关节置换术、关节镜手术、关节僵直微创松解术等)以及各类骨关节功能障碍康复方案。另外，对颈、肩、腰腿痛和软组织急慢性劳损等伤病的康复治疗也积累了丰富的经验，建立了集预防、临床治疗和康复为一体的医疗模式。科室开展业务还涉及急性炎症(如支气管炎、肺炎、面神经炎、乳腺炎、麦粒肿等)、外科感染(如丹毒、甲沟炎、脓性指头炎)、伤口、内脏和心肺疾病康复治疗。 康复医学科自组建以来，依托综合性大医院的优势，与各临床科室密切配合，逐渐形成了自己的专科特色。(1)物理因子：采用电、光、声、磁、蜡、牵引、手法等非药物方法治疗，缓解各种炎性疼痛，促进肌肉关节功能恢复;(2)现代康复技术：应用运动治疗、作业治疗、平衡训练、本体感觉治疗、步态训练、生物反馈、神经发育疗法、运动再学习法、矫形器、辅助器具等各种治疗措施，进行增强功能、补偿功能、训练功能，提高病患功能的生命质量，促进病患潜在功能得到最大的发挥;(3)中西医结合：综合应用物理因子、现代康复技术以及中国传统医学手段(如针灸、推拿)，尽最大努力帮助患者减轻病痛，恢复机体功能，最终回归家庭社会。

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