儿科成立于1962年，骨干来自广州、上海，共有医护人员19人。毕业于中山医科大学、对儿科学深有造诣的主任医师卓育章，是我院儿科的创始人之一，也是衡阳市儿科学的开拓者。他治疗“新生儿破伤风”享有盛誉，他领衔的我院儿科，在六十至八十年代，独占市内鳌头。
　　1985年开设了危重患儿抢救室和新生儿病室，使抢救成功率和新生儿存活率明显提高。1987年，庄淑华接任科主任，开展了“正常和病理儿童血液流变学的测定”，“大剂量海俄辛抢救重型呼吸衰竭”；“中西药综合治疗新生儿高胆红素血症和防治核黄疸”、“新生儿死亡和多器官功能衰竭”等一系列科研活动。
　　1991年，开设新生儿专科病房，一改过去普专混治的状况，开创了新生儿救护工作新局面。1993年，杨惠霞接任科主任，主持开展了“新生儿行为测定”、 “小儿哮喘以吸入治疗为主的阶梯式治疗”、“小儿急性白血病的治疗”、“ 肺炎患儿甲状腺功能观察”、“危重症新生儿血糖变化观察”等新技术和科研。1991年~1998年，先后派出5名医师、4名护士分别到湖南省儿童医院、上海第二医科大学附属新华医院、苏州大学附属儿童医院进修儿科血液病、肾脏病、心血管病、新生儿急救，使儿科技术水平进一步提高。1997年，李桂媛接任科主任，在小儿出血性、溶血性疾病和小儿白血病及新生儿疾病的治疗上取得新的进展。她主持开展的“肺炎患儿甲状腺功能测定” 、“新生儿感染血糖测定”及“大剂量氨甲喋啶对白血病的治疗观察”均获省级科技进步奖。医院并入南华大学后，儿科一直承担了《儿科学》临床教学任务。2006~2007年，承担了1项南华大学研究课题和1项衡阳市科委课题。2007年，何少为接任科主任。2008年，刘晓日担任副主任。近两年，在正、副科主任的带领下，在小儿川崎、重型毛支、重症哮喘、婴儿肝炎综合症，难治性病毒上呼吸道感染、新生儿肺透明膜病、极低出生体重患婴等疾病的救治上又取得了明显进展。现有医师8人，其中正高1人、副高2人、主治1人、医师4人。

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