1937年组建四川省立南充民众教育馆卫生所设药房；1949年改为四川省立南充医院药房；1952年成立药局；1959年组建中药房，之后合并为药剂科。2011年根据卫生部颁布的《医疗机构药事管理规定》更名为药学部，下设西药剂科、中药剂科、临床药学科。西药剂科下设有门诊药房、住院药房、嘉陵分院药房、西药库、制剂室、药检室、制剂库；中药剂科下设有中成药房、中药饮片药房、中成药库房、中药制剂室。
　　南充市中心医院药剂科技术人才：药学部共有技术人员77人，其中主任药师(教授)3人，副主任药师(副教授)12人，主管药师20人，药剂师34人，药剂士及其他8人。硕士研究生8人，大学本科学历34人，专科学历33人，执业药师19人，其中执业中药师4人。
　　南充市中心医院药剂科技术水平：拥有法国进口多效液相色谱仪、紫外可见分光光度计等200多万元的精密仪器，用于药品的检验和科研，具有药代动力学、生物等效性、新制剂开发等多种科研能力。投资300万元改造的制剂室通过了国家标准验收，能配制“滴眼剂、大容量注射剂、胶囊剂”等17种剂型，46个中西药医院制剂。2002年中西药房被南充市药监局授予首批“质量放心药房”；2006年成为卫生部临床药师培训基地；2011年获中国医院协会“第二届全国医院药事管理优秀奖”；2012年成为国际合理用药网络中国中心组高风险用药人群药物管理组成员单位。
　　南充市中心医院药剂科学术水平：完成卫生部科研项目1项，省市重点科研项目5项，获国家新药证书1项，国家发明专利1项。有1项获四川省科技进步三等奖，有1项获四川省卫生厅科技进步二等奖，有1项获南充市科技进步三等奖。近三年，在四川省科技厅、卫生厅、中医药管理局、南充市科技局立项科研项目7项，已完成3项。近十年公开发表科研学术论文200多篇。
　　南充市中心医院药剂科学科建设：有五人分别在四川省医院协会、四川省医院协会要是管理专业委员会、四川省药学会、四川省药学会临床药学专委会、四川省医学会医院药学专委会、南充市药学会、南充市中医药学会、南充市医院协会等学术团体担任副主任委员、常务委员、副理事长、秘书长等职务；有两人分别在《中国药业》、《西部医学》杂志担任编委。

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