儿科成立于1956年，老一辈儿科专家为儿科的发展建设、培养儿科专业技术人才呕心沥血，精湛技术和高尚的道德风范代代相传。儿科为南京军区优生优育中心主体科室，设有小儿内科病区、母婴病房、儿科门诊、儿童生长发育保健科、儿童哮喘中心、儿科门诊输液室。现有主任医师1人，副主任医师2人，主治医师3人，医师3人。儿科在紧抓临床工作的同时，一直注重抓好科研及教学工作，多年来获全军军队科技进步奖三等奖4项、四等奖2项，获全军军队医疗成果三等奖一项、医院医疗成果奖一等奖一项、二等奖5项、三等奖4项。多次被上级党委评为基层建设先进单位、先进党支部、医疗达标先进科室、医德医风先进科室、新闻报道先进单位、并授予儿科集体三等功2次及儿科门诊输液室集体三等功2次、儿科集体嘉奖多次。
　　儿科是军区优生优育中心工作：80年代儿科已具有较健全的儿童保健制度，88年被军区评为八一医院优生优育技术指导站。2000年经军区卫生部及儿科专家的考核及批准升格为军区计划生育优生优育中心。中心坚持面向部队，面向基层，开展儿童保健系统管理，为部队和地方儿童进行健康体检、健康儿童营养智力发育监测、病残儿鉴定，开展儿童心理咨询、儿童心理行为测定、儿童智力筛查、儿童营养测定、儿童微量元素测定。为小儿生长发育及喂养提供指导，并开展小儿厌食症、儿童矮小症、小儿肥胖症等特色诊治，以及儿童优育优教指导工作。常年为儿童常见病的防治进行宣教，多次对部队和地方开办形式多样的电视、广播及现场讲座及家长学校，内容为“儿童心理及其教育”、“小儿呼吸道反复感染的防治”、“小儿厌食症的防治”、“小儿意外伤害的预防和急救”、“幼儿园春季传染病的防治”及“手足口病”等，受到家长们的热烈欢迎。中心自制宣传录像带、录音带、幻灯片，编写优生优育科普书籍、小册子，对部队和地方儿童保健工作起到较好的促进作用。十年来，儿科与妇产科、检验科等相关科室共同努力三次荣获全国优生优育计划生育先进单位。
　　儿科过敏性疾病暨儿童哮喘中心：开办该专科十几年以来，对支气管哮喘(包括过敏性咳嗽)、过敏性鼻炎、过敏性结膜炎、花粉症及各种皮肤过敏症进行变应原检测(点刺法、体外过敏原检测法)，查找过敏原，并在南京地区和军内率先开展特异性免疫疗法(脱敏治疗)，取得较好疗效。成立了儿童哮喘中心，引进肺功能检测仪，通过检测肺功能分析病情严重度、指导治疗，并按照国际哮喘组织指定的GINA方案进行综合治疗及特异性脱敏免疫治疗，有效地控制了哮喘症状、减少复发。本专业从开始单一病种的儿童哮喘到多种变态反应疾病的治疗，从小儿到成人过敏性疾病，从市内到省外病人的增多，知名度逐渐增高，多次应邀在江苏、南京电视台开办小儿哮喘电视讲座、多次开办形式多样的小儿哮喘夏令营及冬令营，举办趣味生动的哮喘知识讲座及有奖问答，受到家长和孩子们的欢迎。儿科及时总结临床经验，所开展的小儿哮喘临床及基础研究，获全军军队医疗成果三等奖一项、医院医疗成果二、三等奖多项。

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