神经内科是淮安市临床重点专科，成立于1960年，是全市最早的专科之一，因医院业务发展需要，于2004年7月分为神经内Ⅰ科、神经内Ⅱ科，目前有南医大副教授、主任医师1人、副主任医师2人、主治医师4人、住院医师1人、医学硕士2人，先后输送硕士生5名，开放床位100张。
　　神经内科依靠先进的神经科影像检查及神经电生理检查仪器，如1.5T磁共振、16排全身螺旋CT、大C臂DSA、单光子发射脑扫描、经颅超声多普勒、24小时动态脑电图、肌电图、诱发电位，以及我院拥有的市临床检验中心、放免中心、高效液相色谱检查等优势，神经内科的检查方法与诊断技术在市内堪称领先。
　　神经内科在脑卒中治疗方面已开展颅内动脉和颈动脉支架植入、颅内动脉瘤介入填塞术和微创血肿穿刺清除术。还配备了高氧液体治疗仪、脉冲电刺激、偏瘫治疗仪、神经功能重建仪，结合医院的高压氧舱、体外反搏、康复治疗中心的康复治疗，极大地改善了急慢性脑血管病患者的治疗效果。在治疗癫痫、多发性硬化、急性脊髓炎、急性多发性神经炎、末梢神经炎、周期性麻痹、重症肌无力、以及头痛、头昏、疼痛、麻木、瘫痪、抽搐、语音障碍等方面疗效显著。在神经科疑难病例的诊断方面也具有很高的水平，所承担的心理咨询门诊，为广大心理障碍性疾病的患者提供了良好的治疗途径。

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