淮安市妇幼保健院新生儿科成立于1984年，是江苏省市级妇幼保健院中成立最早、规模最大、设备条件最好的新生儿专科之一。1999年5月经淮安市卫生局批准成为“淮安市新生儿重症监护中心”。同年被淮安市卫生局批准为首批淮安市医学临床重点专科。目前医生21人，其中主任医师5人，研究生6人，在读研究生3人。现拥有医疗用房面积约1600平方米，重症监护中心床单元10张，设新生儿重症监护中心、早产儿室、足月儿室、隔离室、婴儿高压氧治疗室、专科实验室、人乳库、沐浴室、接待室、VIP病房、特婴室、换血治疗室、出院指导室、示教室等。
　　新生儿科现有呼吸机11台（有创呼吸机七台，其中高频呼吸机二台，无创呼吸机四台），进口暖箱三台，进口监护仪35台等一流设备。2009年出院新生儿2515人次，2010年出院新生儿2483人次，近5年来抢救极低体重儿近1000例，成功率达80%，2008年抢救成功的最低孕周33+6W、最低体重800克的超未成熟儿“豌豆公主”在中央二、十套播出后引起巨大反响。1998年在市内率先成功开展应用呼吸机治疗新生儿呼吸衰竭、新生儿肺出血，成功率达85%左右。2004年引进早产儿视网膜病筛查技术，对符合标准的早产儿进行视网膜病筛查，为尽早发现、尽早治疗早产儿视网膜病提供可能，也为早产儿氧气治疗的安全性提供保障。2005年开展了经外周动、静脉同步换血术治疗新生儿ABO、RH溶血症、新生儿败血症，取得满意疗效，该技术荣获2006年淮安市卫生局新技术引进一等奖。
　　新生儿科在香港万志仁基金会的捐助下，新生儿科于2003年起对周边的区、县、市等医院抢救患儿进行转运，转运由技术熟练的医生和护士担任，安全、快捷，最大限度地争取到抢救时间，也最大限度地保证了抢救成功率，提高了小儿终身生活质量，取得了良好的社会效益及经济效益，2009年转运285人次，2010年转运300余人次，转运覆盖了淮安、扬州、宿迁、连云港等地区。《早期干预对新生儿血铅水平的影响的研究》获得省卫生厅新技术引进一等奖、市卫生局科技进步三等奖，《呼吸机治疗新生儿呼吸衰竭的临床研究》等研究多次获得市卫生局新技术引进奖；2006年引进新生儿外周血管同步换血治疗新生儿溶血病项目荣获淮安市卫生局新技术引进一等奖。《产前给药沐舒坦、地塞米松影响胎肺发育的临床与基础对比研究》（2008年）、《早期干预对极低体重儿生长发育的影响的研究》（2006年）、《脂联素及其受体与肥胖关系》（2006年）的课题研究分别获淮安市科技进步三等奖。

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