康复科作为医院的重点建设科室之一，是广州市正骨医院一个富有中医特色的骨科康复专科科室。是广东省康复医学会理事单位、广东省康复医学会社区康复专业委员会主要发起单位之一、越秀区肢体残疾康复技术指导中心、香港针灸学会临床培训基地、中国社工协会康复医学科研基地。
康复科在继承传统的同时增加了现代医学的物理治疗，为方便患者获得更专业化的医疗服务，特设脊柱病治疗室、膝关节病治疗室、肩关节治疗室，并不断组织我科医务人员对新技术、新理念的学习和更新，以加快我科的进一步发展与提高。作为广东省康复医学会社区康复专业委员会主要发起单位之一和越秀区肢体残疾康复技术指导中心，我科积极与社区康复部门交流，通过在技术和管理上的支持与指导，以及授课等形式，提高社区康复水平；并帮扶省内多家医院并与部分基层医院结盟为长期合作单位，加强合作与交流。在2010年亚运会期间，为阿联酋足球队提供康复治疗的支持，助该队获得了亚军的历史最好成绩！
康复科目前开展有针灸、按摩、拔火罐、小针刀、关节松动术、核心力量训练、神经松动术、PNF等运动疗法和作业疗法，物理治疗拥有各种不同的理疗设备100多台（包括超激光治疗仪9台、超声波治疗仪5台、低周波治疗仪20台、微电脑牵引床5台、中药熏蒸治疗床6张、中药硬膏热敷贴治疗仪--创伤疼痛快速愈合敷贴仪7台、超声波药物导入治疗仪21台、熥烙宝治疗仪39台、气压治疗仪4台、制冰机3台、蜡疗槽1台，并拥有髋关节功能训练器、膝关节功能训练器、踝关节功能训练器、肩肘关节功能训练器、腕指关节训练器、平衡杆、肩梯等先进设备），对各种骨折及骨关节损伤后功能障碍的康复治疗、风湿性关节炎、退行性病变、腰腿痛、腰肌劳损、颈椎病、肩周炎、网球肘、高尔夫球肘等有良好疗效，深受病患者欢迎，2009年日平均门诊治疗量为1800余人次。

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