神经外科是福建省第一流的神经外科中心，也是全国神经外科继续教育基地之一。它由神经外科临床、立体定向放射外科（伽马刀治疗研究中心）组成、福建省神经外科研究所挂靠于本科。设有显微神经外科、立体定向神经外科、放射神经外科、血管内神经外科、内窥镜神经外科、以及锁孔神经外科研究室，此外还下设中枢神经系统肿瘤、先天性疾病、脑血管病，以及脑、脊髓损伤研究室。
　　
　　神经外科瞄准和适应国际发展趋势，具有一批高素质、高学历、年轻的学术队伍。其中教授、主任医师3人，副教授、副主任医师5人，博士、硕士学位7人，留学归国者2人。他们精力充沛，团结协作，善于改革，勇于创新，在省内外率先开展了十余项新业务新技术，脑干肿瘤的手术治疗达国内领先水平，有的达到国际先进水平。难治性颅底肿瘤手术的总例数和全切除率以及巨大复杂性脑动脉瘤手术治疗的成功率居全国先进行列，在省内首先开展了介入栓塞治疗脑血管病，经蝶入路切除垂体腺瘤，锁孔入路切除前颅底、鞍区及CPA肿瘤等多项新技术，填补了省内空白，且达到国内一流水平，其中应用普通灯泡的钨丝栓塞治愈严重的颈内动脉海绵窦瘘和巨大颅内动脉瘤开国内国际之先河。全科人员不断探索，开拓创新，发展并丰富了微侵袭神经外科，从而进一步提高了疗效，减少了病人的痛苦和费用，成为深受广大患者所欢迎的先进的神经外科治疗模式。
　　神经外科拥有当前国际上最先进的医疗设备，包括加拿大完整的全套癫痫刀系统，日本和美国的手术导航系统，两台美国超声手术刀，日本Olympus手术显微镜和德国蔡司公司顶级配置的NC4手术显微镜，日本Mizuho和德国MAQUET显微外科手术床，两套完整的头架、头圈和自动牵开器，美国3M公司和德国蛇牌气动颅钻、磨钻系统，激光手术系统，8台手术单、双极电凝系统（德国蛇牌3台，美国force-2台，日本2台，法国1台），全套蛇牌神经内窥镜、手术全过程视频、记录和刻录系统以及全功能的生理监护系统。此外，还拥有一批进口的基础研究的仪器设备，如CO2培养箱、恒温水浴箱、PCR仪、超低温冰箱、超净工作台、Olympus生物显微镜和荧光倒置显微镜 、病理分析和图文处理系统，以及分子生物学研究的仪器设备等。伽马刀的引进和应用于临床，使本科一跃成为能够开展几乎所有神经外科现代治疗技术的单位之一。每年完成各类手术千余台，其中外伤手术占15%左右。择期手术占85%，基本杜绝了手术“二进宫”现象。手术难度方面，大手术占3/4，高难度手术占1/3，包括脑动脉瘤、脑血管畸形、以及脑干、海绵窦、岩斜坡区、丘脑、第三脑室前、后部和枕大孔区的肿瘤，许多在其他单位未能解决的或仅部分解决的病例，经本科再次手术而得以康复，除胶质瘤手术全切率在85-90%外，良性肿瘤的全切除率达98%，并经CT或MR复查所证实预后及生存质量好，疗效达到国内外先进水平。
　　神经外科以国际一流模式的装备和管理确保病人的治疗效果，全体员工严谨求实，精益求精，开拓进取，勇于创新，临床、教学、科研均处于本学科领域的前沿。已经举办省级神经外科学习班和研讨班16个，为全省神经外科事业的发展提供帮助。负责16项国家级、省部级的研究攻关课题，其中重大项目3个，已获得省部级和厅级科研究成果13项，在权威性学术刊物上发表论文200余篇，主编用参编8部书著。全科紧跟世界潮流，勤奋奉献，不但医德高尚，而且技术超群，吸引来自全省、全国以及东南亚各国的患者，为我省我国神经外科事业做出突出贡献。他们将继续努力，以“以一流的设备，一流的技术，一流的服务”为宗旨，以雄厚的综合实力为患者提供领先水平的、全方位的医疗服务。

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