神经外科创建于上世纪50年代，是我国最早的神经外科专科病房之一，也是卫生部全国首批三大神经外科临床医生培训基地之一。老一代神经外科专家吴和光教授、丘瑅光教授、高立达教授等为学科的创建和发展倾注了大量心血、做出了巨大贡献。经过几代华西人的不懈努力，学科不断发展壮大，已形成了具有自身特色和学术风格的专业，在国内具有较高的知名度，并对我国神经外科事业的发展作出了巨大贡献。在2011年复旦大学全国医院专科排名中位列第三位。目前，神经外科分为脑脊髓血管疾病、前中颅底疾病、后颅底疾病、神经胶质瘤、脊髓疾病、颅脑创伤、功能神经外科、立体定向放射神经外科、小儿神经外科、神经介入等十个亚专业，并严格按照亚专业收治病员。科室现有正式床位181张，用于康复及后续治疗床位100余张，床位使用率130%，并与成都市内多家医院建立双向转诊，病员来自全国各地。神经外科年门诊量超过三万人次，年病人7500余人次，年开颅手术量4400余台，伽马刀及血管内介入手术2000余台。是西南地区最大的神经外科基地。专业细化、专病专治、多学科联合攻关、规范化医疗及手术管理等举措，使科室越来越成为疑难重症神经外科疾病诊治的中心，疾病构成发生了巨大的变化。复杂颅内血管病、颅底肿瘤、脑深部病变、功能神经外科、复杂颅颈交界区病变等，成为了治疗的主体，超过手术病例的70%以上。在颅脑外伤、癫痫外科、颅咽管瘤的基础与临床研究、环枕部先天畸形的外科治疗、脑血管病、帕金森病等功能神经疾病的治疗等方面，处于国内先进水平。
　　神经外科目前共有医师31人，其中正高职称10人，副高职称14人，中级8人，有博士学位20人。科室共有博士导师3人，硕士导师14人，在全国各级学术团体任编任职21人次，包括中华医学会副会长、中国医师协会、神经肿瘤专委会委员、常委、副主任委员等职务。在省内各学术团体任编任职11人次，包括省市神经外科专委会委员、常委、副主任委员、主任委员等职务。在全国各专业医学杂志任编任职40余人次，包括中华医学杂志英文版、中华创伤杂志英文版、中华神经外科杂志等。中华神经外科杂志编辑部华西分部于2006年正式成立。
　　神经外科如今，已建立起了合理的学术梯队，在继承学科传统优势的同时，瞄准国际前沿，注重新技术的开展和新领域的拓展。以亚专业划分与发展为契机，以指导临床应用的基础与临床研究为切入点，整合信息学、影像学、材料学的综合优势，跟踪国际前沿研究方向，利用循证医学（evidence based medicine, EBM）和卫生技术评估（health technique assessment, HTA）提供的方法学基础，力争向更高的目标发展和跨越。

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