北京儿童医院眼科成立至今已有40余年的历史，在医院领导的大力支持下，不断发展壮大，由最初的单一门诊发展成为目前拥有门诊（包括专家、专业和普通门诊）、病房、验光配镜中心、弱视训练为一体的综合性小儿眼科。现有医护技人员共55人，其中医生21名，视光技师及弱视训练师5名，护士29名。包括正主任医师2名，副主任医师4名，主治医师5名。博士1名，硕士16名。历经多年努力和人才梯队建设，队伍不断壮大、专业日趋完善，临床技术精湛、仪器设备先进、具有较高的学术水平。每年接诊来自全国各地的各种眼病患儿近12万人次，日均门诊量400余人次，高峰日均500-600人次左右，暑期门诊量最高可达900人次。
　　北京儿童医院眼科目前设有泪道专业、斜弱视专业、验光配镜专业。在小儿斜视、泪道疾病、眼整形、近视弱视治疗、特种眼镜验配、视网膜母细胞瘤治疗等方面居国内领先水平，有的接近或达到国际水平。
　　北京儿童医院眼科病房设有病床34张，年均手术量3500余例。为解决儿童斜视再手术率高的难题，于刚主任、吴倩主任经过多年课题攻关，采取了经过多年临床实践自创改良眼外肌后徙调整缝线技术，使手术的一次成功率高达90%以上，取得良好治疗效果。眼科病房还开展了其他的特色治疗项目：Ritleng泪道插管手术、泪道球囊管扩张手术、利用GORE-TEX新型材料额肌悬吊术治疗儿童上睑下垂、儿童视网膜母细胞瘤综合治疗等，首创的全新微创泪道再建手术达到了国际先进水平，治愈各种儿童复杂性泪道疾患近30000例。
　　北京儿童医院眼科在科、教、研方面，眼科承担首都医科大学7年制儿科系的教学任务，承担每年来自全国各地基层小儿眼科进修医师的培训工作，已经在专业期刊上发表论文数十篇，在SCI上发表论文数篇。

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