普外科从1955年张金哲院士开创以来，普外专业一直是儿童医院外科的基础专业和重点专业。经过50多年的发展壮大，并由此派生出其他专业，如急症外科、肿瘤外科、新生儿外科等。现普外专业拥有病床30张，年完成手术1200余例。目前年过90岁的张金哲院士仍然每周定时出门诊、查房，带领着普外的各级医师继续为儿外科事业发展而奋斗。主要专家包括邱晓虹主任医师、陈亚军主任医师、王大勇主任医师、张廷冲副主任医师、李小松副主任医师等。
　　普外科先天性巨结肠根治术已完成1000余例，从张院士等发明改进环钳治疗，到使用胃肠吻合器，再到腹腔镜辅助完成根治术及经肛门改良Soave术式取得了一系列成绩，在国内享有较好的声誉，国际上亦有影响。
　　普外科经过实验研究对先天性胆总管扩张症，设计应用了加强防返流措施的肝总管空肠R-Y吻合加矩形瓣成型术，有效地防止术后返流，此手术设计引起国内、国际上的兴趣。该手术已完成1000余例，近期、远期效果满意。胆道闭锁的手术治疗近10年有了重大发展，患儿术后胆汁引流率100%，良好率近50%，总体疗效令人鼓舞。
　　普外科对于难治复杂的肛门直肠畸形的研究与治疗也在不断进行探索，特别是在复杂肛门直肠畸形和一穴肛的功能性修复水平不断提高，对排便控制，排便功能训练的研究不断深入。同时，适应国际小儿外科发展趋势，在微创腔镜外科方面也在不断探索实践。
　　普外科在诊断、治疗大量患儿及疑难病症的病例中，积累了丰富的临床经验。多年来，通过医疗、科研对一些疾病如先天性肛门直肠畸形、先天性肝胆脾胰疾病等的术前诊断和术后处理均进行不断完善，对手术技术不断的进行改进创新，减少或消灭其术后并发症。在完善手术方案及技术的同时，重视患儿围手术期的监测和管理，肠内、肠外营养也广泛用于临床。
　　普外科近年来，注意在临床、教学、科研方面的均衡发展，是博士学位授予单位和博士后流动站，已培养博士研究生及硕士研究生40多人。在核心期刊及SCI上发表论文200余篇，获国家科技部攻关课题、北京市自然科学基金、北京市优秀人才基金、北京市教委科研基金等多项基金支持，并获得北京市科技进步奖、国家卫生部及北京市卫生局等奖项，并有《实用小儿外科学》、《小儿门诊外科学》、《实用小儿新型手术图解》等多部专著出版。
　　普外科诊治的主要病种包括：先天性胆总管囊肿、胆道闭锁、小儿颈部先天性疾病、先天性巨结肠、先天性肛门直肠畸形、后天性肛门直肠疾患、结肠息肉、门脉高压、消化道出血、消化道畸形、大网膜或肠系膜囊肿、腹壁疝、腹股沟斜疝等。

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