北京儿童医院急诊科在儿科急诊专业基础上于2012年8月正式成立，承担各种小儿急危重症的抢救和治疗工作，是集医疗、教学、科研为一体的专业学科，在全国儿科急诊中居于领先水平。
　　北京儿童医院急诊科由急诊内科抢救、急诊外科、急诊留观、急诊输液、急诊化验室、急诊放射科、急诊药房和急诊手术室等组成，并有一套规范合理的抢救流程和操作常规。以“迅速准确有效”为救治理念，急诊科在心肺脑复苏、严重感染性疾病、各种儿科慢性疾病急诊危象、小儿中毒与意外伤害等临床抢救上积累了丰富的经验。以小儿有创和无创呼吸机治疗为特色，开展了急诊床旁检测技术，包括血气分析、血电解质测定、炎症标记物检测、心肌标记物测定等项目。
　　北京儿童医院急诊科每年接诊来自北京市和全国各省市的患儿超过20万人次，每年抢救急危重症患儿超过2万人次，抢救成功率达99%以上。急诊外科每年诊治6万5千余人次，清创缝合7千多人次，急诊病房手术1千多例，其中80%阑尾炎和全部美克尔憩室行腹腔镜手术治疗。
　　北京儿童医院急诊科目前初步拥有一批高素质的医疗服务团队，所有科室医生均接受了儿科高级生命支持班的培训，医师团队中硕士以上学历占60%，高级职称占25%。护理团队护士全部拥有大专及以上学历，中高级职称占20%。
　　北京儿童医院急诊科在完成繁重的临床工作之余，以严重脓毒症、休克、多脏器功能障碍、呼吸衰竭为科研重点，主持和参与了多项国家级继续教育项目。急诊外科病房还承担首都医科大学七年制学生临床实习的带教工作，以及护校及研究生的临床实习、科研工作。

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