上海第九人民医院普外科是医院院的重点学科，是上海交通大学疝与腹壁外科疾病诊治中心，大肠癌、乳房疾病、甲状腺疾病和胆道疾病诊治分中心。
　　普外科常规开展包括甲状腺疾病、乳房疾病、疝与腹壁缺损、胃肠道肿瘤、肝胆结石与肿瘤、胰腺炎症与肿瘤、急腹症、腹部外伤、腋臭、嵌甲等在内的所有普外科疾病的手术及治疗。其中消化道肿瘤的外科治疗、乳房疾病微创治疗、乳房癌的外科治疗（特别是乳癌切除后即刻再造）、各种疝、复杂腹壁缺损（特别是腹壁肿瘤的手术治疗）成为科室的特色医疗项目。科室在腔镜腹部外科手术（二镜或三镜联合）、甲状腺微创手术、晚期肿瘤介入治疗、内镜逆行胰胆管造影（ERCP）、腋臭与嵌甲的治疗方面均处于国内领先水平。

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