上海第六人民医院药剂科设门诊药房、特需药房、急诊药房、住院药房、中药房、儿科药房、静脉药物配置中心、制剂室、质检室、临床药学研究室、药库、临床药理等15 个分科；现有药学专业技术人员130 人，其中正高3 名，副高2 名，中级10 余名。临床药学研究室近几年主持省市级以上课题10 余项。该科为上海交通大学、复旦大学、上海医药职工大学、上海药剂学校等院校的本科、大专、中专生实习、见习基地，同时为上海交通大学和上海中医药大学博士点，每年向全国招生。
　　上海第六人民医院药剂科全面加强药事质量管理，落实药剂科标准化管理，取得显著成绩。在卫生部和上海市医院管理年检查中多次获得好评，成绩均名列前茅。2008年被上海市药学会授予医院药学管理奖，2009年、2011年、2012年连续三年被评为上海市临床药事管理先进单位。2008年、2009、2010年连续获得卫生部抗菌药物临床应用监测网优秀成员单位奖。2011年获得第二届全国医院药事管理优秀奖。

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