启东市中医院（南通启东市中医院）与汇龙中心卫生院分离，迁址新建于1991年1月。经过二十多年的努力，医院规模与声誉日益扩大，现已成为一所具有中西医结合特色的，集医疗、教育、科研为一体的二级甲等中医医院、国家级爱婴医院、南京中医药大学实习医院、启东市华侨诊疗中心。
启东市中医院占地面积19018.9平方米，建筑面积41066平方米，在建的10层13560平方米的门诊楼已封顶，将于2014年3月投入使用。医院现有工作人员530名，卫技人员占90.94%，具有高级职称76人，中级职称142人，硕士研究生26人。拥有江苏省有突出贡献中青年专家1人、� �333工程”培养对象1人、南通市科技专业技术拔尖人才2人、南通市新世纪科学技术带头人培养对象3人、南通市名中医2人、启东市拔尖人才3名、启东市“321”工程培养对象1名。
启东市中医院开设临床及医技科室40个，耳鼻咽喉科为江苏省中医重点建设专科、南通市中医重点专科，中西医结合外科是南通市中医重点专科，骨伤科是南通市中医重点建设专科，康复科、脾胃科、心病科、眼科、老年病科和性病科即将申报南通市中医重点专科。在此基础上，医院注重西医的齐头并进，加强高新技术的开发和应用，使医疗技术迅速发展。除了开展常见的手术外，还开展了放射介入治疗，心肌梗塞、脑梗塞的早期溶栓治疗，永久性和临时性心脏起博器安装;胰、十二指肠切除、肝切除，胃癌、肠癌的综合性治疗，肺癌切除，食道癌切除，妇科各种恶性肿瘤根治;鼻窦镜手术，腹腔镜下肠癌根治，子宫肌瘤、卵巢切除，膝关节镜治疗;全髋置换，人工股骨头、肩关节、膝关节置换，交锁髓内钉应用;全喉切除发音重建、妇科盆底重建;各种颅脑外伤颅内血肿清除，颅骨修补等高难度手术。医院核编床位数320张目前实际开放428张。12年完成总门诊量近20万人次、收住病人近2万人次、床位使用率超过100%。
启东市中医院拥有最新东芝64排128层CT机、德国西门子双板DR机、核磁共振机、C臂机、意大利原装进口1000毫安多功能数字化X光机（DSA）、进口彩超4台、进口全自动生化仪2台、血气分析仪、CCU中央监护系统。还拥有费森尤斯4008S和瑞典金宝AK95S多功能血透仪20台，国内最新型的体外冲击波碎石机、多人高压氧舱、全自动呼吸机、多功能麻醉机、进口高清腹腔镜、膝关节镜、电切镜、电子胃肠镜、支气管镜等大中型医疗设备，近期又更新了西门子1.5TAVanto18通道核磁共振仪及大型心型彩超。病房楼装有中央空调、中心供氧、中心吸引、冷热水系统、信息管理系统，医院全面实行信息化管理。这些功能先进的设施设备不仅满足医院医教研工作需要，更促进了医疗技术水平向更高更快发展。根据名老中医药专家提供的临床验方，医院制剂室常年生产9个品种的特色制剂，深受广大患者的欢迎。
启东市中医院近年来先后获得江苏省最佳满意综合性医院、江苏省医疗卫生标兵示范医院、江苏省计量工作先进单位、江苏省中医药宣传工作先进单位、南通市文明单位、南通市文明诚信窗口单位、南通市先进基层党组织、南通市卫生系统先进集体、南通市卫生系统先进基层党组织、启东市先进基层党组织、启东市党建工作示范点、启东市文明单位、启东市价格诚信单位、启东市五星级医院等称号。
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