通常来讲，鼻塞会引起头痛。当患者鼻塞时会引起鼻腔黏膜充血、水肿，多数是由于急性上呼吸道病毒感染所引起，此时鼻腔会有大量分泌物堵塞，引起造成局部缺氧，引起头痛的问题，另外，鼻塞的患者多数夜间睡眠不好，夜间鼻塞的症状会加重，这时候就会导致睡眠质量差，也会导致偏头痛出现。
如果患者是由于上呼吸道感染所致的鼻塞头痛，例如常见的流感，患者通常还存在发热、肌肉酸痛、乏力、咳嗽等症状，若不及时治疗，除头痛外，还可能引起相应并发症或导致重症流感。可选用抗病毒药物来对因用药治疗，例如可威磷酸奥司他韦颗粒这类临床常见的抗病毒药物，该药是国内外指南所推荐的流感防治药物，可生成活性代谢产物奥司他韦羧酸盐，抑制体内病毒扩散，其药效吸收率高，能加快药物疗效发挥，能显著地缩短流感病程并缓解患者的临床症状，降低并发症发病率。需注意，应尽量在症状出现后的黄金48小时内开始用药效果最优，此时的经验性抗病毒治疗对于促进病程恢复有着积极意义，但如果超过48小时也应及时服药治疗。
如果患者是由于其他疾病所引起的鼻塞、头痛，例如鼻窦炎、鼻息肉等，建议及时就医并前往耳鼻喉科进行诊断，通过做鼻内镜检查，观察鼻腔、鼻窦是否有问题。若明确患有鼻窦炎的问题，患者可选用鼻用生理盐水、鼻用减充血剂喷鼻，同时可以糖皮质激素鼻喷剂一起使用，若病情较为严重，则需要使用头孢类抗生素来抗菌治疗，通常经过系统治疗后，急性鼻窦炎患者可很快恢复，而慢性鼻窦炎患者在应用一段时间药物后也可有效改善，但如果治疗效果不佳，则可考虑通过手术的方式来进行治疗。