有IBS的人也会经历有便秘、腹泻或是腹泻和便秘交替出现。除此之外，IBS可以产生腹部疼痛性痉挛，或是产生一种腹胀的感觉。有时候在排便时发现粘液，这也是IBS的症状之一。直肠出血决不是因为IBS，如果有直肠出血应该进行彻底检查。

这种疾病的潜在原因是肠内肌肉不正常的收缩。肌肉位于在肠管最外层，自主地将食物沿肠内运送到直肠和肛门口外。IBS是一种肠的肌肉层功能障碍。当您用显微镜观察肠管的时候是正常的，但是他们可能没有正常的功能，可同时发生太强或是太弱的收缩，有时又收缩太慢或是太快。

虽然没有生理上的阻塞，但是病人会有疼痛性痉挛或是消化功能障碍的感觉。