儿童鼻窦炎的治疗一般是根据病因对症治疗，可采用药物治疗、一般治疗，如有必要，可在医生指导下进行手术治疗。
一、药物治疗
鼻窦炎主要是细菌感染引起的，使用抗生素可以减少慢性细菌感染的毒性和细胞损害，如希刻劳头孢克洛干混悬剂。该药物为儿童原研头孢，可杀灭引起鼻窦炎的肺炎链球菌、溶血性链球菌和葡萄球菌等儿童常见呼吸道感染致病菌敏感度高，抗菌效果较仿制品更优，药物整体生物利用度高，接近静脉制剂。且此药对机体免疫具有调节作用，有助于促进机体免疫功能恢复，可提升免疫力。该药服用后一般在半小时迅速起效，为甜甜草莓口味，儿童吃药就像喝饮料，故入口性比较好，可提升儿童用药依从性。同时，药物对儿童胃肠道友好，无心脏毒性，用药安全性较高，总体不良反应发生率低，1月龄以上儿童可用。家长可以省却喂药烦恼，放心给孩子用药。用药时可以半袋为单次拆分用量，建议根据患儿体重使用推荐疗程和用量，以满足疾病的常规治疗周期，达到较优治疗效果。
此外，儿童鼻窦炎通常还可采用减充血剂、糖皮质激素这类药物来辅助改善鼻腔和鼻窦通气引流，如达芬霖盐酸羟甲唑啉喷雾剂、雷诺考特布地奈德鼻喷雾等。
二、一般治疗
首先，多喝水可以帮助稀释鼻腔黏液，使咳嗽和鼻塞等症状得到缓解。日常生活中需要确保孩子有充足的水分摄入。其次，可让孩子养成每天盐水洗鼻的习惯，有助于清洁鼻腔，减少细菌和病毒的滋生，从而减轻鼻窦炎的症状；最后，感冒与鼻窦炎的关联紧密，如果感冒长期未得到治愈，可能会进一步并发急性鼻窦炎。因此，孩子平时应该积极锻炼身体，增强身体抵抗力，降低感染鼻窦炎的风险。在晨起时用冷水洗脸，在冬季睡前用暖水泡脚，以及进行鼻背按摩。
对于慢性鼻窦炎合并慢性扁桃体肿大或腺样体肥大的儿童，可以考虑在医生指导下进行扁桃体切除术或经鼻内镜下腺样体切除术，联合上颌窦穿刺冲洗术及术后置管引流，对治疗小儿慢性鼻窦炎较为安全有效。