1.血管性病变
动脉硬化、动脉粥样硬化、高血压等心血管病变，常在眼睛出现对应性变化。若长期血压控制不佳或发生恶性高血压时，可能会造成视网膜缺血或出血、血管阻塞、视盘水肿，甚至网膜脱离等现象。
2.中枢神经系统病变
颅内肿瘤或血管瘤常造成视神经或视觉皮质受压迫，致使病人低视力或视野缺损。负责眼球运动的脑神经亦可能受压迫而导致复视，多发性硬化症可能以视神经炎或眼外肌麻痹为主要表现。
3.结缔组织及关节病变
此类疾病多与免疫系统失调相关，如类风湿性关节炎、僵直性脊椎炎、莱特症候群、贝西症候群等常并发虹膜炎。休格连症候群常有明显的干眼、系统性红斑狼疮、皮肌炎、多发性动脉炎等，常造成视网膜缺血栓塞与视盘水肿。
多数全身性疾病的眼睛表现的症状查知后，可转其他科配合治疗。某些全身性疾病引起眼病变后，为不可逆性反应，如糖尿病视网膜病变，若在病变发生影响到视力后，再来控制血糖，对视力恢复已不可能，所以及早发现，及早治疗是必须的。尤有甚者，许多严重或致命的疾病，如脑瘤、脑卒中、高血压、糖尿病及肝病等，也可从眼检查中及早发现，及早治疗，挽回生命。