现代医学认为，扁桃体属于末梢性免疫器官。但扁桃体处于特殊解剖上的“守门”位置，使其成为呼吸道局部和全身免疫的重要器官。

1、扁桃体中富有各种吞噬细胞，可吞噬和消灭病菌。

2、扁桃体可以制造具有天然免疫力的细胞和抗体，如T细胞、B细胞、吞噬细胞等以及免疫球蛋白。

3、扁桃体产生调节生长发育的内分泌素；

4、扁桃体具有调节钙和糖的新陈代谢的作用；

5、扁桃体可产生性激素。

因此，对于从血液、淋巴或其他组织侵入机体的有害物质，扁桃体具有积极的防御作用。

中医院扁桃体专科疗法特别，将扁炎软膏（原名：“扁咽消”、“扁炎消”）直接贴于下颌部与扁桃体相对应处，以达到清热解毒，消肿散结的目的。扁炎软膏属纯中药贴剂，作用直接，在急性发作时贴有治疗作用，在不急性发作时贴有清除病灶的作用，可以使反复发作的扁桃体炎不反复发作。